Predicted ligand sequences


ADAN-name: 2C1T3.PDB (view again the scoring matrix)

PDB name: [2C1T.PDB]

Wild-type ligand sequence and binding properties                 (Help)

WT T K V A S S A V M N R R K I A M P K R
position 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19
poly-Ala
A
 A
A
A
 A
A
A
A
 A
A
A
 A A
A
A
 A
A
A
 A

Grey: Restrictive positions; only 1 or 2 residues predicted after FoldX analysis

Yellow: Tolerant positions; more than 10 residues predicted after FoldX analysis

 

WT ligand    

(Help)

Intraclash 1.783 ΔGbinding -8.035
TOTAL
 -6.252
Backbone Hb -3.625 Cis_bond 0.000
Sidechain Hb -2.725 Torsional clash 0.414
Van der Waals -11.663 Backbone clash 1.135
Electrostatics -3.282 Helix dipole 0.050
Solvation Polar 15.098 Water bridges 0.005
Solvation Hyd -14.892 Disulfide 0.000
VdW clashes 2.828 Electrost. Kon -2.545
Entropy sc 4.759 Part.cov.bonds 0.000
Entropy mc

7.543

 ΔGstability

-27.594
       

Predicted ligand sequences for template [2C1T3.PDB]

(from FoldX scoring matrices).
If your favourite sequence is not included in this list, please visit the ADAN section Prediction from a query sequence).
 
  2C1T3.PDB  

(data)
# Predicted Sequences Value Calculate
1 MTGRYWFRFPFMsIMMPGY 0.0
2 MTGRYWPRFPFMFIMMPGY 0.0
3 MTGRYWFRFPFMFIMMPGY 0.0
4 MTGRYWPRFPFMsIMMPGY 0.0
5 MTPRYWPRFPFMsIMMPGY 0.02
6 MTGRYWPRFPRMFIMMPGY 0.02
7 MTPRYWPRFPFMFIMMPGY 0.02
8 MTGRYWPRLPFMsIMMPGY 0.02
9 MTGRYWFRFPRMsIMMPGY 0.02
10 MTGRYWFRLPFMsIMMPGY 0.02
11 MTGRYWPRFPRMsIMMPGY 0.02
12 MTGRYWFRLPFMFIMMPGY 0.02
13 MTGRYWFRFPRMFIMMPGY 0.02
14 MTPRYWFRFPFMFIMMPGY 0.02
15 MTGRYWPRLPFMFIMMPGY 0.02
16 MTPRYWFRFPFMsIMMPGY 0.02
17 MTPRYWFRFPRMFIMMPGY 0.03
18 MTPRYWPRFPRMFIMMPGY 0.03
19 MTPRYWPRLPFMFIMMPGY 0.04
20 MTPRYWFRLPFMsIMMPGY 0.04
21 MTGRYWPRLPRMFIMMPGY 0.04
22 MTPRYWPRLPFMsIMMPGY 0.04
23 MTPRYWPRFPRMsIMMPGY 0.04
24 MTPRYWFRFPRMsIMMPGY 0.04
25 MTGRYWFRLPRMFIMMPGY 0.04
26 MTGRYWPRFPFMFIMMPGR 0.04
27 MTGRYWFRFPFMFIMMPGR 0.04
28 MTPRYWFRLPFMFIMMPGY 0.04
29 MTGRYWPRLPRMsIMMPGY 0.04
30 MTGRYWFRLPRMsIMMPGY 0.04
31 MTPRYWPRLPRMFIMMPGY 0.05
32 MTGRYWPRFPFMKIMMPGY 0.05
33 MTGRYWFRFPFMsIMMPGR 0.05
34 MTPRYWFRLPRMFIMMPGY 0.05
35 MTGRYWFRFPFMKIMMPGY 0.05
36 MTGRYWPRFPFMsIMMPGR 0.05
37 MTGRYWPRFPRMFIMMPGR 0.06
38 MTPRYWPRFPFMFIMMPGR 0.06
39 MTPRYWFRLPRMsIMMPGY 0.06
40 MTGRYWPRFPRMKIMMPGY 0.06
41 MTGRYWYRFPFMFIMMPGY 0.06
42 MTGRYWFRFPRMsIMMPGR 0.06
43 MTGRYWYRFPFMsIMMPGY 0.06
44 MTGRYWPRFPRMsIMMPGR 0.06
45 MTGRYWFRLPFMFIMMPGR 0.06
46 MTGRYWFRFPRMFIMMPGR 0.06
47 MTPRYWFRFPFMFIMMPGR 0.06
48 MTGRYWFRFPRMKIMMPGY 0.06
49 MTGRYWPRLPFMFIMMPGR 0.06
50 MTPRYWPRLPRMsIMMPGY 0.06
51 MTGRYWPRFPFMsIMFPGY 0.07
52 MTPRYWYRFPFMFIMMPGY 0.07
53 MTPRYWPRFPFMsIMMPGR 0.07
54 MTGRYWYRFPRMFIMMPGY 0.07
55 MTGRYWPRLPFMsIMMPGR 0.07
56 MTGRYWFRFPFMsIMFPGY 0.07
57 MTPRYWFRFPFMKIMMPGY 0.07
58 MTGRYWFRLPFMsIMMPGR 0.07
59 MTGRYWFRLPFMKIMMPGY 0.07
60 MTGRYWFRFPFMFIMFPGY 0.07
61 MTPRYWPRFPFMKIMMPGY 0.07
62 MTPRYWFRFPFMsIMMPGR 0.07
63 MTGRYWPRFPFMFIMFPGY 0.07
64 MTGRYWPRLPFMKIMMPGY 0.07
65 MTGRYWPRFPLMFIMMPGY 0.08
66 MTGRYWFRFPLMsIMMPGY 0.08
67 MTPRYWPRLPFMFIMMPGR 0.08
68 MTPRYWFRFPRMsIMMPGR 0.08
69 MTPRYWFRLPFMsIMMPGR 0.08
70 MTGRYWFRLPRMKIMMPGY 0.08
71 MTGRYWPRLPRMFIMMPGR 0.08
72 MTPRYWPRLPFMsIMMPGR 0.08
73 MTPRYWFRLPFMKIMMPGY 0.08
74 MTPRYWPRFPRMsIMMPGR 0.08
75 MTPRYWFRFPRMFIMMPGR 0.08
76 MTPRYWFRLPFMFIMMPGR 0.08
77 MTPRYWPRFPRMKIMMPGY 0.08
78 MTGRYWFRFPLMFIMMPGY 0.08
79 MTGRYWFRLPRMFIMMPGR 0.08
80 MTGRYWPRLPRMKIMMPGY 0.08
81 MTGRYWYRFPRMsIMMPGY 0.08
82 MTGRYWYRLPFMFIMMPGY 0.08
83 MTPRYWFRFPRMKIMMPGY 0.08
84 MTPRYWPRFPRMFIMMPGR 0.08
85 MTGRYWFRLPRMsIMMPGR 0.08
86 MTGRYWPRLPRMsIMMPGR 0.08
87 MTPRYWPRLPFMKIMMPGY 0.08
88 MTPRYWYRFPFMsIMMPGY 0.08
89 MTGRYWPRFPLMsIMMPGY 0.08
90 MTGRYWYRLPFMsIMMPGY 0.08
  (binding_energy)(dif)  (stability_energy)(dif)

(data)

  

(Help)
# Precalculated Models Intraclash ΔGbinding Total
1 MTPRYWFRLPFMsIMMPGY

1.71

-18.71

-17.0
2 MTPRYWPRFPRMsIMMPGY

1.98

-18.35

-16.37
3 MTGRYWPRFPFMFIMMPGR

1.46

-17.63

-16.17
4 MTGRYWFRFPFMsIMMPGY

1.47

-17.3

-15.83
5 MTGRYWFRFPFMFIMMPGR

1.38

-17.1

-15.72
6 MTPRYWFRFPRMFIMMPGY

1.08

-16.69

-15.61
7 MTGRYWFRFPRMFIMMPGY

1.52

-17.11

-15.59
8 MTGRYWPRFPFMFIMMPGY

1.75

-17.07

-15.32
9 MTGRYWPRLPRMsIMMPGY

2.36

-17.5

-15.14
10 MTPRYWFRFPRMsIMMPGY

1.35

-15.84

-14.49
11 MTPRYWFRFPFMsIMMPGY

1.42

-15.67

-14.25
12 MTPRYWPRFPFMsIMMPGY

2.05

-15.91

-13.86
13 MTGRYWFRFPRMsIMMPGY

2.6

-16.08

-13.48
14 MTGRYWPRLPRMFIMMPGY

2.27

-15.72

-13.45
15 MTPRYWPRLPFMFIMMPGY

2.33

-15.78

-13.45
16 MTGRYWFRLPRMFIMMPGY

1.08

-14.31

-13.23
17 MTGRYWFRFPFMFIMMPGY

1.99

-14.66

-12.67
18 MTPRYWPRLPFMsIMMPGY

4.65

-16.88

-12.23
19 MTPRYWPRFPRMFIMMPGY

1.53

-12.74

-11.21
20 MTGRYWPRFPRMsIMMPGY

2.05

-13.01

-10.96
21 MTPRYWPRFPFMFIMMPGY

1.1

-11.92

-10.82
22 MTGRYWPRFPFMsIMMPGY

1.33

-11.69

-10.36
23 MTGRYWPRFPRMFIMMPGY

1.66

-11.91

-10.25
24 MTGRYWPRLPFMsIMMPGY

2.18

-11.85

-9.67
25 MTGRYWPRLPFMFIMMPGY

1.38

-10.85

-9.47
26 MTPRYWFRFPFMFIMMPGY

1.54

-10.64

-9.1
27 MTGRYWFRLPFMFIMMPGY

5.19

-13.41

-8.22
28 MTGRYWFRLPFMsIMMPGY

4.33

-11.92

-7.59
29 MTGRYWFRLPRMsIMMPGY

4.59

-12.04

-7.45
30 MTPRYWFRLPFMFIMMPGY

3.81

-11.2

-7.39

 NOTE: No more than 10 sequences can be selected for new calculations.

If your favourite sequence is not included in this list, please visit the ADAN section Prediction from a query sequence.

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