Predicted ligand sequences


ADAN-name: 1I7X5.PDB (view again the scoring matrix)

PDB name: [1I7X.PDB]

Wild-type ligand sequence and binding properties                 (Help)

WT D Y D Y L N E W G N R F K K L A D M Y G
position 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
poly-Ala
A
 A
A
A
A
 A A
A
 G A
A
A
 A
A
A
A
 A
A
 A
G

Grey: Restrictive positions; only 1 or 2 residues predicted after FoldX analysis

Yellow: Tolerant positions; more than 10 residues predicted after FoldX analysis

 

WT ligand    

(Help)

Intraclash 7.299 ΔGbinding -20.529
TOTAL
 -13.230
Backbone Hb 0.000 Cis_bond 0.000
Sidechain Hb -0.375 Torsional clash 0.574
Van der Waals -11.518 Backbone clash 0.564
Electrostatics -1.646 Helix dipole 0.000
Solvation Polar 5.990 Water bridges 0.036
Solvation Hyd -20.173 Disulfide 0.000
VdW clashes 1.121 Electrost. Kon -1.326
Entropy sc 6.113 Part.cov.bonds 0.000
Entropy mc

0.675

 ΔGstability

88.398
       

Predicted ligand sequences for template [1I7X5.PDB]

(from FoldX scoring matrices).
If your favourite sequence is not included in this list, please visit the ADAN section Prediction from a query sequence).
 
  1I7X5.PDB  

(data)
# Predicted Sequences Value Calculate
1 DIWWLNHWHRFWCWMNNWCG 0.0
2 DIWWMNHWHRFWCWMNNWCG 0.01
3 DIWWLNHWHRFWCWMNSWCG 0.04
4 DIWWMNHWHRFWCWMNSWCG 0.06
5 DIWWLNHWHRFWHWMNNWCG 0.07
6 DIWWMNHWHRFWHWMNNWCG 0.08
7 DIWWLNHWHRFWCWMNNMCG 0.08
8 DIWWLHHWHRFWCWMNNWCG 0.08
9 DIWWLNHWHRFWCWMTNWCG 0.09
10 DIWWLNHWMRFWCWMNNWCG 0.09
11 DIWWMNHWHRFWCWMNNMCG 0.09
12 DIWWLNHWHKFWCWMNNWCG 0.09
13 DIWWLNHWHRFWCWLNNWCG 0.09
14 DIWWMHHWHRFWCWMNNWCG 0.1
15 DIWWMNHWHRFWCWLNNWCG 0.1
16 DIWWMNHWMRFWCWMNNWCG 0.1
17 DIWWMNHWHRFWCWMTNWCG 0.11
18 DIWWLNHWHRFFCWMNNWCG 0.11
19 DIWWLNHWHRFWHWMNSWCG 0.11
20 DIWWMNHWHKFWCWMNNWCG 0.11
21 DMWWLNHWHRFWCWMNNWCG 0.11
22 DIWWLNHWHRFWCWMNNWMG 0.12
23 DIWWLNHWHRFWCWMNSMCG 0.12
24 DAWWLNHWHRFWCWMNNWCG 0.12
25 DIWWLHHWHRFWCWMNSWCG 0.12
26 DMWWMNHWHRFWCWMNNWCG 0.12
27 DIFWLNHWHRFWCWMNNWCG 0.13
28 DIWWMNHWHRFFCWMNNWCG 0.13
29 DIyWLNHWHRFWCWMNNWCG 0.13
30 DIWWLNHWHRFWCWLNSWCG 0.13
31 DIWWMNHWHRFWHWMNSWCG 0.13
32 DIWWLNHWHRFWCWMTSWCG 0.13
33 DAWWMNHWHRFWCWMNNWCG 0.13
34 DIWWLNHWHPFWCWMNNWCG 0.13
35 DIWWLNHWMRFWCWMNSWCG 0.13
36 DIWWLNHWHKFWCWMNSWCG 0.13
37 DIWWMHHWHRFWCWMNSWCG 0.14
38 DIWWMNHWHRFWCWMNNWMG 0.14
39 DIWWLNHWHRFWCWMNHWCG 0.14
40 DIyWMNHWHRFWCWMNNWCG 0.14
41 DIWWMNHWMRFWCWMNSWCG 0.14
42 DIWWMNHWHRFWCWMNSMCG 0.14
43 DIWWMNHWHRFWCWLNSWCG 0.14
44 DIWWLNHWHRFFCWMNSWCG 0.15
45 DIFWMNHWHRFWCWMNNWCG 0.15
46 DIWWLHHWHRFWHWMNNWCG 0.15
47 DIWWMNHWHRFWCWMNHWCG 0.15
48 DIWWLNHWHRFWCWMNNWCs 0.15
49 DIWWMNHWHRFWCWMTSWCG 0.15
50 DIWWMNHWHKFWCWMNSWCG 0.15
51 DMWWLNHWHRFWCWMNSWCG 0.15
52 DIWWLNHWHRFWHWMNNMCG 0.15
53 DIWWMNHWHPFWCWMNNWCG 0.15
54 DAWWLNHWHRFWCWMNSWCG 0.16
55 DIWWLNHWyRFWCWMNNWCG 0.16
56 DIWWLNHWHRFWHWMTNWCG 0.16
57 DIWWLNHWHRFWHWLNNWCG 0.16
58 DIWWLNHWHRFWCWMNSWMG 0.16
59 DIWWLNHWHKFWHWMNNWCG 0.16
60 DIWWLNHWMRFWHWMNNWCG 0.16
61 DIWWLHHWHRFWCWMNNMCG 0.16
62 DIWWMNHWHRFWHWMNNMCG 0.16
63 DIWWLNHWHKFWCWMNNMCG 0.17
64 DIWWLNHWHPFWCWMNSWCG 0.17
65 DIWWLHHWHKFWCWMNNWCG 0.17
66 DIWWLHHWMRFWCWMNNWCG 0.17
67 DMWWMNHWHRFWCWMNSWCG 0.17
68 DIWWMNHWHKFWHWMNNWCG 0.17
69 DIFWLNHWHRFWCWMNSWCG 0.17
70 DAWWMNHWHRFWCWMNSWCG 0.17
71 DIWWLHHWHRFWCWLNNWCG 0.17
72 DIWWMNHWHRFWCWMNNWCs 0.17
73 DIWWMNHWHRFFCWMNSWCG 0.17
74 DIWWLNHWMRFWCWMNNMCG 0.17
75 DIWWMHHWHRFWHWMNNWCG 0.17
76 DIWWMNHWMRFWHWMNNWCG 0.17
77 DIWWLNHWHRFWCWMTNMCG 0.17
78 DIWWMNHWHRFWHWMTNWCG 0.17
79 DIyWLNHWHRFWCWMNSWCG 0.17
80 DIWWMNHWHRFWHWLNNWCG 0.17
81 DIWWMNHWyRFWCWMNNWCG 0.17
82 DIWWLNHWHRFWCWLNNMCG 0.17
83 DIWWLHHWHRFWCWMTNWCG 0.17
84 DIWWLNHWHKFWCWLNNWCG 0.18
85 DIWWLNHWMRFWCWMTNWCG 0.18
86 DIWWMNHWMRFWCWMNNMCG 0.18
87 DIWWLNHWHRFFHWMNNWCG 0.18
88 DIWWMNHWHRFWCWLNNMCG 0.18
89 DIWWLNHWHRFWCWLTNWCG 0.18
90 DIWWLNHWMKFWCWMNNWCG 0.18
  (binding_energy)(dif)  (stability_energy)(dif)

(data)

  

(Help)
# Precalculated Models Intraclash ΔGbinding Total
1 DIWWLNHWHRFWCWMNSMCG

13.26

-15.21

-1.95
2 DIWWLNHWHRFWCWMNNWCG

14.57

-15.58

-1.01
3 DIWWLNHWHRFWHWMNNWCG

14.25

-15.26

-1.01
4 DIWWLNHWHKFWCWMNNWCG

15.32

-15.45

-0.13
5 DIWWLHHWHRFWCWMNSWCG

14.9

-14.73

0.17
6 DMWWMNHWHRFWCWMNNWCG

8.71

-8.0

0.71
7 DMWWLNHWHRFWCWMNNWCG

13.72

-11.73

1.99
8 DIWWLNHWHRFWCWMTNWCG

13.89

-10.0

3.89
9 DAWWLNHWHRFWCWMNNWCG

12.06

-8.07

3.99
10 DIWWMNHWMRFWCWMNNWCG

12.29

-8.01

4.28
11 DIWWLNHWHRFFCWMNNWCG

9.56

-4.54

5.02
12 DIWWMNHWHRFWCWMNNMCG

17.22

-12.08

5.14
13 DIWWMNHWHRFWHWMNNWCG

17.21

-11.35

5.86
14 DIWWLNHWHRFWCWLNNWCG

16.42

-8.96

7.46
15 DIWWLNHWHRFWCWMNSWCG

19.9

-12.17

7.73
16 DIWWLNHWHRFWCWLNSWCG

17.1

-7.39

9.71
17 DIWWMHHWHRFWCWMNNWCG

13.88

-3.46

10.42
18 DIWWLNHWMRFWCWMNNWCG

11.68

-0.88

10.8
19 DIWWMNHWHRFWCWMNNWCG

15.49

-4.31

11.18
20 DIWWMNHWHKFWCWMNNWCG

15.65

-4.26

11.39
21 DIWWLNHWHRFWCWMNNMCG

15.07

-3.67

11.4
22 DIWWMNHWHRFWCWMNSWCG

19.47

-8.03

11.44
23 DIWWLNHWHRFWCWMNNWMG

18.19

-6.74

11.45
24 DIWWMNHWHRFWCWMTNWCG

11.07

0.56

11.63
25 DIWWMNHWHRFWCWLNNWCG

13.31

-1.16

12.15
26 DIWWLNHWHRFWHWMNSWCG

16.51

-3.99

12.52
27 DIWWLHHWHRFWCWMNNWCG

19.11

-6.19

12.92
28 DIyWLNHWHRFWCWMNNWCG

15.88

-2.8

13.08
29 DIFWLNHWHRFWCWMNNWCG

10.24

6.18

16.42
30 DIWWMNHWHRFFCWMNNWCG

24.23

-6.55

17.68

 NOTE: No more than 10 sequences can be selected for new calculations.

If your favourite sequence is not included in this list, please visit the ADAN section Prediction from a query sequence.

NOTE: No more than 10 sequences can be selected for new calculations.

If your favourite sequence is not included in this list, please visit the ADAN section Prediction from a query sequence.

  Comments or questions on the site? Send a mail to adandatabase@umh.es                                                             DISCLAIMER