Predicted ligand sequences


ADAN-name: 1I7W3.PDB (view again the scoring matrix)

PDB name: [1I7W.PDB]

Wild-type ligand sequence and binding properties                 (Help)

WT S L L V F D Y E G s G s E A A S L s S L
position 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
poly-Ala A
A
 A A
A
 A
A
A
G
A
G
A
A
 A A A A
A
 A A

Grey: Restrictive positions; only 1 or 2 residues predicted after FoldX analysis

Yellow: Tolerant positions; more than 10 residues predicted after FoldX analysis

 

WT ligand    

(Help)

Intraclash 3.700 ΔGbinding -26.152
TOTAL
 -22.452
Backbone Hb -4.963 Cis_bond 0.000
Sidechain Hb -7.338 Torsional clash 1.557
Van der Waals -19.456 Backbone clash 0.437
Electrostatics -5.986 Helix dipole -0.015
Solvation Polar 23.547 Water bridges -0.537
Solvation Hyd -28.237 Disulfide 0.000
VdW clashes 1.739 Electrost. Kon -2.792
Entropy sc 8.094 Part.cov.bonds 0.000
Entropy mc

8.235

 ΔGstability

-111.794
       

Predicted ligand sequences for template [1I7W3.PDB]

(from FoldX scoring matrices).
If your favourite sequence is not included in this list, please visit the ADAN section Prediction from a query sequence).
 
  1I7W3.PDB  

(data)
# Predicted Sequences Value Calculate
1 MRIRSRFEGEGDySMWyDyL 0.0
2 MRIRSRFEGEGDyDMWyDyL 0.0
3 MRIRSRFEGEGDySDWyDyL 0.0
4 MRIRSRFEGEGDyDDWyDyL 0.01
5 MRIRSRFEGEGDyDDWyDDL 0.05
6 MRIRSRFEGEGDyDMWyDDL 0.05
7 MRIRSRFEGEGDySMWyDDL 0.05
8 MRIRSRFEGEGDySDWyDDL 0.05
9 MRIRSKFEGEGDySMWyDyL 0.05
10 MRIRSKFEGEGDySDWyDyL 0.05
11 MRIRSKFEGEGDyDMWyDyL 0.05
12 MRIRSKFEGEGDyDDWyDyL 0.06
13 MRIRSRFEGsGDySMWyDyL 0.06
14 MRIRSRFEGsGDyDMWyDyL 0.06
15 MRIRSRFEGsGDySDWyDyL 0.06
16 MRIRSRFEGsGDyDDWyDyL 0.06
17 MRIRSKFEGEGDyDMWyDDL 0.1
18 MRIRSKFEGEGDyDDWyDDL 0.1
19 MRIRSKFEGEGDySMWyDDL 0.1
20 MRIRSRFEGsGDySMWyDDL 0.1
21 MRIRSKFEGEGDySDWyDDL 0.1
22 MRLRSRFEGEGDySMWyDyL 0.1
23 MRLRSRFEGEGDyDMWyDyL 0.1
24 MRIRSRFEGEGDyDLWyDyL 0.1
25 MRIRSRFEGsGDySDWyDDL 0.1
26 MRLRSRFEGEGDyDDWyDyL 0.1
27 MRIRSRFEGsGDyDMWyDDL 0.1
28 MRIRSRFEGEGDySLWyDyL 0.1
29 MRLRSRFEGEGDySDWyDyL 0.1
30 MRIRSKFEGsGDySMWyDyL 0.11
31 MRIRSRFEGsGDyDDWyDDL 0.11
32 MRIRSKFEGsGDyDDWyDyL 0.11
33 MRIRSKFEGsGDySDWyDyL 0.11
34 MRIRSKFEGsGDyDMWyDyL 0.11
35 MRIRSRFEGEGDyDMWyDYL 0.12
36 MRMRSRFEGEGDySMWyDyL 0.12
37 MRIRSRFEGEGDySDWyDYL 0.12
38 MRIRSRFEGEGDyDDWyDYL 0.12
39 MRIRSRFEGEGDySMWyDYL 0.12
40 MRMRSRFEGEGDyDMWyDyL 0.12
41 MRIMSRFEGEGDyDMWyDyL 0.13
42 MRMRSRFEGEGDyDDWyDyL 0.13
43 MRIMSRFEGEGDySMWyDyL 0.13
44 MRMRSRFEGEGDySDWyDyL 0.13
45 MRIMSRFEGEGDyDDWyDyL 0.13
46 MRIMSRFEGEGDySDWyDyL 0.13
47 MRIRSRFEGEGDyDLWyDDL 0.14
48 MRLRSRFEGEGDySMWyDDL 0.14
49 MRIRSRFEGEGDySLWyDDL 0.14
50 MRIRSKFEGsGDyDMWyDDL 0.15
51 MRIRSRFEGsGDyDLWyDyL 0.15
52 MRLRSKFEGEGDyDDWyDyL 0.15
53 MRIRSRFEGEGDyHDWyDyL 0.15
54 MRIRSRFEGsGDySLWyDyL 0.15
55 MRLRSRFEGEGDySDWyDDL 0.15
56 MRLRSKFEGEGDyDMWyDyL 0.15
57 MRLRSRFEGEGDyDDWyDDL 0.15
58 MRIRSRFEGEGDyHMWyDyL 0.15
59 MRIRSKFEGEGDyDLWyDyL 0.15
60 MRIRSRFEGQGDySMWyDyL 0.15
61 MRIRSRFEGQGDyDMWyDyL 0.15
62 MRIRSRFEGQGDySDWyDyL 0.15
63 MRLRSKFEGEGDySDWyDyL 0.15
64 MRIRSKFEGsGDySMWyDDL 0.15
65 MRLRSRFEGsGDySMWyDyL 0.15
66 MRLRSRFEGEGDyDMWyDDL 0.15
67 MRIRSKFEGEGDySLWyDyL 0.15
68 MRLRSKFEGEGDySMWyDyL 0.15
69 MRIRSKFEGsGDySDWyDDL 0.16
70 MRLRSRFEGsGDyDMWyDyL 0.16
71 MRIRSRFEGQGDyDDWyDyL 0.16
72 MRLRSRFEGsGDySDWyDyL 0.16
73 MRIRSKFEGsGDyDDWyDDL 0.16
74 MRLRSRFEGsGDyDDWyDyL 0.16
75 MRIRSKFEGEGDySMWyDYL 0.17
76 MRMRSRFEGEGDySMWyDDL 0.17
77 MRIRSRFEGEGDyDMWLDyL 0.17
78 MRIRSKFEGEGDyDMWyDYL 0.17
79 MRIRSRFEGsGDyDMWyDYL 0.17
80 MRIRSKFEGEGDySDWyDYL 0.17
81 MRIRSRFEGEGDySDWLDyL 0.17
82 MRIRSRFEGsGDySMWyDYL 0.17
83 MRIRSRFEGEGDyDDWLDyL 0.17
84 MRMRSRFEGEGDyDMWyDDL 0.17
85 MRIRSKFEGEGDyDDWyDYL 0.17
86 MRMRSKFEGEGDyDMWyDyL 0.17
87 MRMRSRFEGEGDyDDWyDDL 0.17
88 MRIRSRFEGEGDySMWLDyL 0.17
89 MRMRSRFEGEGDySDWyDDL 0.17
90 MRIMSRFEGEGDySMWyDDL 0.17
  (binding_energy)(dif)  (stability_energy)(dif)

(data)

  

(Help)
# Precalculated Models Intraclash ΔGbinding Total
1 MRIRSRFEGEGDySMWyDyL

4.63

-38.73

-34.1
2 MRIRSKFEGEGDyDMWyDyL

4.75

-38.78

-34.03
3 MRIRSKFEGEGDySMWyDyL

3.99

-37.11

-33.12
4 MRIRSRFEGEGDyDMWyDyL

4.63

-37.18

-32.55
5 MRLRSRFEGEGDySMWyDyL

5.14

-37.41

-32.27
6 MRIRSRFEGEGDySLWyDyL

5.74

-37.99

-32.25
7 MRIRSKFEGEGDySMWyDDL

5.45

-37.22

-31.77
8 MRIRSKFEGEGDyDMWyDDL

4.29

-35.58

-31.29
9 MRIRSRFEGsGDySMWyDDL

5.06

-36.31

-31.25
10 MRIRSKFEGsGDySMWyDyL

4.87

-36.1

-31.23
11 MRIRSRFEGEGDyDDWyDDL

4.29

-35.36

-31.07
12 MRIRSRFEGEGDyDLWyDyL

4.33

-35.17

-30.84
13 MRIRSRFEGEGDyDMWyDDL

4.34

-35.03

-30.69
14 MRIRSRFEGEGDySMWyDDL

7.38

-38.0

-30.62
15 MRIRSKFEGEGDySDWyDyL

5.25

-35.6

-30.35
16 MRIRSRFEGsGDyDMWyDyL

4.18

-34.49

-30.31
17 MRIRSRFEGsGDyDMWyDDL

5.86

-36.06

-30.2
18 MRIRSKFEGEGDyDDWyDyL

4.54

-34.72

-30.18
19 MRLRSRFEGEGDyDMWyDyL

4.35

-34.35

-30.0
20 MRLRSRFEGEGDyDDWyDyL

4.45

-34.41

-29.96
21 MRIRSRFEGsGDySDWyDyL

4.92

-34.76

-29.84
22 MRIRSRFEGsGDySMWyDyL

4.93

-34.59

-29.66
23 MRLRSRFEGEGDySDWyDyL

4.95

-34.55

-29.6
24 MRIRSRFEGEGDySDWyDDL

4.86

-34.4

-29.54
25 MRIRSKFEGEGDyDDWyDDL

5.74

-35.13

-29.39
26 MRIRSRFEGsGDyDDWyDyL

6.9

-35.51

-28.61
27 MRIRSRFEGEGDyDDWyDyL

4.3

-32.31

-28.01
28 MRIRSRFEGsGDySDWyDDL

5.24

-33.01

-27.77
29 MRIRSKFEGEGDySDWyDDL

7.3

-35.04

-27.74
30 MRIRSRFEGEGDySDWyDyL

6.07

-32.4

-26.33

 NOTE: No more than 10 sequences can be selected for new calculations.

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